უნივერსიტეტში ამჟამად მოქმედებს ერთი სადოქტორო პროგრამა – უსაფრთხოების კვლევები.
პროგრამის ხელმძღვანელია პროფ. დავით თევზაძე.
სადოქტორო პროგრამა -უსაფრთხოების კვლევები 2007-2010
სადოქტორო პროგრამა - უსაფრთხოების კვლევები 2010-2013
2009 წლიდან უნივერსიტეტში მიმდინარეობს მოლაპარაკება ერთობლივი სადოქტორო პროგრამის განხორციელებაზე
კლინიკურ ფსიქოლოგიაში, ადიქტოლოგიაში პრაღის კარლოვის უნივერსიტეტის პირველ სამედიცინო ფაკულტეტისა და აიბი ევრო–კავკასიურ უნივერსიტეტის მონაწილეობით.
პირველი მოსამზადებელი ეტაპისთვის 2010 წლის 08 – 22 აგვისტოს პრაღაში დაგეგმილია საზაფხულო სკოლა. ხელშეკრულებას ხელი მოეწერა 21 მაისს პრაღის საელჩოში, თბილისში.
პროექტის დამფინანსებელია ჩეხეთის განათლებისა და სპორტის სამინისტრო.
ფაკულტეტის სადოქტორო პროგრამაზე სწავლების დებულება
აკადემიური და სამეცნიერო ნაშრომის წარმოდგენის საუნივერსიტეტო სტანდარტი
აიბი ევრო-კავკასიური უნივერსიტეტის საგანმანათლებლო პროცესის დებულება